CIA

Schließlich gelang es Offizieren der Special Activities Division (SAD) der CIA, den Spezialkräften des United States Special Operations Command (USSOCOM) und der Nordallianz gemeinsam, die Taliban zu stürzen, ohne dass das US-Militär konventionelle Bodentruppen einsetzen musste. Hamid Karzai wurde am 22. Dezember als neuer Präsident Afghanistans vereidigt. Zu diesem Zeitpunkt zählte der Krieg nur 13 Soldaten oder CIA-Offiziere, die an der von den USA geführten Militärkampagne beteiligt waren, sowie mindestens 1.500 bis 2.375 afghanische Zivilisten, die vor allem bei Bombenangriffen der US-Luftwaffe oder der Marine starben.

Der scheinbar erfolgreiche Militäreinsatz in Afghanistan, der offiziell als „Operation Enduring Freedom“ bezeichnet wurde, wurde in den USA von beiden Seiten gelobt und von den amerikanischen Medien als „Vorbote einer neuen Art von Krieg“ (Coll) gefeiert. Nach der Invasion wurde jedoch deutlich, dass den US-Politikern ein langfristiger Plan zur Bekämpfung der großen Armut und Unterentwicklung in Afghanistan fehlte und dass die Errichtung eines stabilen Nachfolgeregimes eine außerordentliche Herausforderung darstellen würde. Coll kommentiert, dass „der schockierend schnelle Erfolg der von der CIA inspirierten Kampagne zum Sturz der Taliban die Erwartungen so sehr übertraf, dass er einige ihrer Architekten für ihre eigenen Grenzen blind machte“. Crumpton räumte später ein: „Wir haben nicht verstanden, dass wir die Taliban durch etwas Besseres ersetzen mussten“.

Darüber hinaus entkamen bin Laden und Hunderte von Al-Qaida-Kämpfern nach Pakistan, weil Verteidigungsminister Donald Rumsfeld, der Befehlshaber des Zentralkommandos der Vereinigten Staaten, Tommy Franks, und schließlich Präsident Bush beschlossen hatten, sich auf die von der CIA unterstützten afghanischen Milizen Hazrat Ali und Zahir Qadeer (dessen Vater, Haji Abdul Qadeer, bin Ladens Ankunft in Jalalabad 1996 begrüßte) zu verlassen – zusammen mit einem groß angelegten B-52-Bombardement -, anstatt Ranger der US-Armee oder Marines zu schicken.Ranger der US-Armee oder Marines während der Schlacht um Tora Bora im Dezember 2001. Ein alarmierter pakistanischer Präsident Pervez Musharraf fragte Franks: „Was tun Sie? Sie treiben diese Leute [al-Qaida] hinaus und … Sie strömen in mein Land“ und forderte dringend benötigte Hubschrauber an, um 60.000 pakistanische Truppen an die afghanisch-pakistanische Grenze zu verlegen, doch die USA lehnten dies mit dem Hinweis auf den hohen Bedarf an Hubschraubern in anderen Ländern ab.

Franks und Rumsfeld hatten offenbar die Befürchtung, dass eine starke amerikanische Präsenz in der Nähe von Tora Bora eine Rebellion der örtlichen Paschtunen auslösen könnte, obwohl diese zu diesem Zeitpunkt über keinerlei organisatorische Fähigkeiten verfügten und viele CIA-Analysten, darunter Charles E. Allen (der Franks warnte, dass „die Hintertür [nach Pakistan] offen sei“) und Gary Berntsen (der kurzzeitig als Leiter der CIA-Station diente, die informell vom Ariana Hotel in Kabul aus operierte, und der die Army Ranger aufforderte, „dieses Baby in der Krippe zu töten“). Eine Untersuchung des US-Senats stellte fest, dass das strategische Versagen in Tora Bora tiefgreifende Auswirkungen sowohl auf den Verlauf des Konflikts in Afghanistan als auch auf die Zukunft des internationalen Terrorismus hatte; Coll argumentiert, dass es Pakistan destabilisierte und bei den pakistanischen Führern den Eindruck erweckte, dass die zunehmende Gewalt in ihrem Land der Preis für die amerikanische Torheit im Herbst 2001 war.

Ende 2001 und Anfang 2002 baute Schroen in Absprache mit dem ersten Direktor, Muhammad Arif Sarwari, die Nationale Sicherheitsdirektion Afghanistans (NDS) auf. Der NDS übernahm die Arbeitskultur und das Personal des KHAD aus der Sowjetzeit, der gemeinhin als afghanisches Pendant zum KGB bezeichnet wird, aber Schroen zog es vor, SAVAK als Modell für den neuen Geheimdienst zu verwenden.

Geheimdienstliche Analyse
Im Juni 2003 veröffentlichte die CIA einen Bericht mit dem Titel „11. September: The Plot and the Plotters“. Dieses Dokument analysiert den Anschlag vom 11. September und enthält auch CIA-Informationen über Al-Qaida und den Anschlag, einschließlich detaillierter biografischer Angaben zu jedem der Flugzeugentführer. Dem Bericht zufolge stellte die CIA fest, dass die Angreifer immer wieder nach Afghanistan gereist waren und dass die meisten von ihnen nach Afghanistan reisten, um bin Laden ihre Loyalität zu schwören.

Geheimdienstliche Analyse: Afghanische Kriegsanstrengungen verschlechtern sich
Mitte 2006 beauftragte das CIA-Zentrum für Terrorismusbekämpfung den Akademiker Brian Glyn Williams von der University of Massachusetts Dartmouth mit der Durchführung einer Studie, die auch Feldarbeit in Afghanistan und eine (2007 veröffentlichte) Abschlussarbeit umfasste und die dramatische Zunahme von Selbstmordattentaten durch afghanische Aufständische seit diesem Jahr untersuchte. (Während des sowjetisch-afghanischen Krieges wurden, wenn überhaupt, nur wenige Selbstmordattentate dokumentiert, und es ist nicht bekannt, dass die Taliban solche Attentate als Teil ihres Krieges gegen die Nordallianz in den 1990er Jahren sanktioniert hätten.) Williams dokumentierte 149 Selbstmordattentate im Jahr 2006, verglichen mit nur acht Selbstmordattentaten zwischen Dezember 2001 und Dezember 2004, und fand Beweise dafür, dass arabische und internationale Dschihadisten dazu beigetragen haben, diese Taktik als Auswirkung des Irakkriegs nach Afghanistan zu exportieren.

Forward Operating Base Chapman Angriff
Am 30. Dezember 2009 ereignete sich ein Selbstmordanschlag auf die Forward Operating Base Chapman, einen wichtigen CIA-Stützpunkt in der Provinz Chost, Afghanistan. Sieben CIA-Beamte, darunter der Leiter des Stützpunkts, wurden bei dem Anschlag getötet und sechs weitere schwer verwundet. Der Anschlag war nach dem Bombenattentat auf die US-Botschaft in Beirut (Libanon) 1983 der zweittödlichste, der gegen die CIA verübt wurde, und stellte einen schweren Rückschlag für die Arbeit des Geheimdienstes dar.

In den 2010er Jahren führte die CIA ein Programm zur Tötung oder Gefangennahme militanter Anführer mit dem Codenamen ANSOF (früher Omega) durch. Das Personal der CIA wurde durch Mitarbeiter des United States Army Special Operations Command ergänzt.
„Green-on-blue“- oder „Insider-Angriffe“, bei denen afghanische Soldaten oder Polizisten ihre Waffen auf amerikanische oder europäische Kollegen richteten, wurden 2010 zu einem großen Problem und erreichten 2012 ihren Höhepunkt, als sie fast 25 % der ISAF-Todesopfer ausmachten, bevor sie 2013-2014 mit dem Rückzug der internationalen Streitkräfte aus dem Konflikt zurückgingen. Das Ausmaß der Insider-Angriffe schockierte die CIA-Analysten, die kein ähnliches Phänomen während des Vietnamkriegs, des sowjetisch-afghanischen Krieges oder einer anderen Aufstandsbekämpfung in der modernen Geschichte finden konnten.
Mitte 2019 stellte die Nichtregierungsorganisation Human Rights Watch fest, dass „von der CIA unterstützte afghanische Kampftruppen“ seit Ende 2017 „schwerwiegende Verstöße, die teilweise auf Kriegsverbrechen hinauslaufen“, begangen hätten.

Der Direktor des US-Geheimdienstes Central Intelligence Agency, William J. Burns, traf kurz nach der Eroberung der Stadt durch die Taliban am 20. August 2021 in Kabul mit dem hochrangigen Taliban-Beamten Abdul Ghani Baradar zusammen, um den 31. August als Frist für den Abschluss der Evakuierung des Landes durch die USA zu besprechen.